潔凈工程在實驗室中，起著至關重要的作用。實驗室環境的潔凈程度，直接影響著實驗結果的準確性和可重復性，同時對實驗人員的健康也具有重要意義。
潔凈工程有助于提供一個無菌和無塵的環境，避免外界污染物進入實驗室。微小的灰塵粒子可能會對實驗產生不可忽視的影響。通過空氣過濾系統，潔凈工程可有效減少粉塵的存在，確保實驗室環境的潔凈。
某些實驗可能會涉及有害物質的處理，如有毒化學品或放射性物質。潔凈工程通過保持良好的空氣質量和排風系統的運作，減少了人員暴露于有害物質的風險。這種保護措施可以有效保障實驗人員的健康和安全。
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